Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms