Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1aQ9EPL5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1aQ9EPL5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1aQ9EPL5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1aQ9EPL5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1aQ9EPL5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1aQ9EPL5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1aQ9EPL5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp1aQ9EPL5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms