Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CrotQ9DC50 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CrotQ9DC50 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrotQ9DC50 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrotQ9DC50 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrotQ9DC50 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrotQ9DC50 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrotQ9DC50 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrotQ9DC50 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrotQ9DC50 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrotQ9DC50 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrotQ9DC50 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrotQ9DC50 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms