Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ccdc97Q9DBT3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ccdc97Q9DBT3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc97Q9DBT3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc97Q9DBT3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc97Q9DBT3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc97Q9DBT3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc97Q9DBT3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc97Q9DBT3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc97Q9DBT3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc97Q9DBT3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc97Q9DBT3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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