Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tysnd1Q9DBA6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tysnd1Q9DBA6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tysnd1Q9DBA6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tysnd1Q9DBA6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tysnd1Q9DBA6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tysnd1Q9DBA6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tysnd1Q9DBA6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tysnd1Q9DBA6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tysnd1Q9DBA6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tysnd1Q9DBA6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tysnd1Q9DBA6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tysnd1Q9DBA6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms