Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms