Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnpy3Q9DAU1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnpy3Q9DAU1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms