Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DA42 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9DA42 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9DA42 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9DA42 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9DA42 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9DA42 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DA42 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DA42 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DA42 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DA42 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms