Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms