Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hm13Q9D8V0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hm13Q9D8V0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms