Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alg13Q9D8C3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alg13Q9D8C3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms