Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms