Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms