Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms