Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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