Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms