Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms