Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms