Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms