Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyc1Q9D0M3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms