Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms