Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acsl3Q9CZW4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms