Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms