Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms