Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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