Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube2fQ9CY34 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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