Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gtpbp8Q9CY28 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gtpbp8Q9CY28 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gtpbp8Q9CY28 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp8Q9CY28 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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