Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms