Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Prdm5Q9CXE0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Prdm5Q9CXE0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Prdm5Q9CXE0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Prdm5Q9CXE0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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