Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms