Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Xrcc2Q9CX47 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Xrcc2Q9CX47 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Xrcc2Q9CX47 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Xrcc2Q9CX47 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Xrcc2Q9CX47 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc2Q9CX47 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Xrcc2Q9CX47 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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