Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms