Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms