Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms