Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms