Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms