Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd3Q99PL7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms