Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms