Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsnaxip1Q99P25 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsnaxip1Q99P25 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsnaxip1Q99P25 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsnaxip1Q99P25 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsnaxip1Q99P25 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsnaxip1Q99P25 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsnaxip1Q99P25 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsnaxip1Q99P25 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsnaxip1Q99P25 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsnaxip1Q99P25 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsnaxip1Q99P25 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsnaxip1Q99P25 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms