Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl43Q99N89 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms