Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms