Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms