Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms