Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms