Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcc1Q99LI2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms