Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms