Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PpifQ99KR7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PpifQ99KR7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms