Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clint1Q99KN9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms