Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GatbQ99JT1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms