Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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